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Se estandarizó la técnica LSSP (Reacción en Cadena de la Polimerasa con un único oligonucleótido en condiciones de baja astringiencia), para identificar polimorfismos del gen cry1B en aislamientos nativos de Bacillus thuringiensis, para ser utilizados como alternativa para el control biológico de plagas agrícolas en Colombia. Previamente, se evaluó por PCR la presencia de los genes cry1 en 164 aislamientos nativos provenientes del Centro y Caribe Colombiano, identificándose este gen en el 43% de los aislamientos (70), y el gen cry1B en el 16% de estos (11). Estos 11 aislamientos fueron analizados por LSSP-PCR para el gen cry1B y los patrones electroforéticos obtenidos se compararon con los de la cepa de referencia, B. thuringiensis subsp. aizawai HD137. Se obtuvo el patrón de bandas más divergente en el aislamiento nativo BtGC120, este fragmento se secuenció y esta lectura nucleótidica se comparó contra toda la base de datos del NCBI.